第26集 
　　　宝伦回京，要崇祯答允废后、恢复弘遇一党大臣之职，以及取消当日凤台选婿结果才肯调兵守城，崇祯大怒，更立刻安排长平与世显成亲，气煞宝伦。崇祯欲向其于金陵封王的弟弟福王借兵，可惜福王拥兵自重。长平以身作则，劝京城人民放弃个人荣辱，合力保家卫国。昭仁为得到世显，引长平到郊野，将她推落山，并嫁祸闯?，不料长平大难不死，昭仁竟拿刀刺她，却遭长平反击，将她制服带回宫中。昭仁死不认错，还嚷着要与长平公平竞争，圣卿自荐将她带回保定。
　　长平带曾奋力对抗闯?的农家女费贞娥见崇祯，崇祯大受激励，遂带贞娥上殿，着群臣效法她，又命众人跟自己一起搬砖加固北京城城墙，众民见状大受感动。田妃病重垂危，崇祯探望，田妃哀求他留下相伴，遭拒，遂迁怒周后，咒诅她。崇祯发现弘遇等一党大臣早前修筑城墙时偷功减料，引致倒塌，含怒找弘遇等人晦气，却竟见四人分赃并打算南迁，崇祯终忍无可忍怒斩*臣，弘遇苦苦哀求，崇祯方免他一死。
　　福王回京，旨在劝崇祯迁都及交出皇位，太后怒责福王，其身边宠信太监曹化淳即求领五百太监为大明出战，太后赞赏，不料化淳等出宫后竟向闯军投降，以求一线生机，太后得悉后大受打击。

第27集 
　　　　崇祯连接凶讯，绝望之际，三桂来信带精锐之师回京劝王，崇祯大喜。崇祯答应让三桂见圆圆，却惊闻观音庙失火，遂向三桂撒谎，其后接讯圆圆已被烧死，惟有想办法拖延，惜终被三桂看穿，三桂一怒之下离去。圆圆原来被弘遇捉走，设局让人以为她已死，作自己最后一翻身机会。崇祯出现幻觉，以为被他人取笑，苦不堪言。
　　昭仁使计令自己感染风寒，圣卿无奈按她要求送她到宝伦军营，不料昭仁竟设计陷害圣卿，令他被宝伦打成残废。闯军攻北京城，只剩下世显所守的南门未被攻入；其时，宫中大乱，各人争相逃走，崇祯颓然坐在地上，周后与长平上前劝解。昭仁跑回京，向世显哭求保护。众人劝崇祯撤离京城，崇祯却上钟楼敲钟，传文武百官及宗室亲族上殿，原来崇祯为免落在闯?手上，要众人一起殉国，众人闻言，苦苦哀求崇祯收回承命。
　　可法提议南渡江南，崇祯为保尊严不允，后经周后及长平再三游说，崇祯终想到对外发放流言来误导闯?，好让大家有逃生之机，众大喜。崇祯嘱咐各人珍重后，分批撤退。另一方面，世显终守不住南门，着昭仁换平民服一起逃难。崇祯遭闯军截获，吊死在煤山。弘遇将圆圆献给自成求荣。可法带同三十万大军护送周后等人至金陵，慈照被立为摄政王。

第28集 
　　　　昭仁在街头遇上承恩，从他口中得知各人消息，并得到米粮。昭仁却为买药给世显疗伤，出卖承恩等人匿藏之处情?取赏银。世显误信昭仁以为长平已死，茶饭不思，昭仁不停劝解。周后为处理国事心力交瘁，太后即以她抱恙为由，劝她将政事交给慈照学习处理。
　　宝伦不满周后干政，而福王亦对皇位虎视眈眈，决心逼周后退回后宫。慈照见一奏折提议由周后亲政，建泰感可疑，长平逼不得已找正休息的周后。慈照在大殿上被福王逼问周后是否亲政，不知所措之际，周后出现，周后以遵从崇祯遗命化解危机，太后始知朝中豺狼当道。周后经此一役，更体会当日崇祯苦况。宝伦气忿难平，决刺杀周后。满清大臣范文程到山海关游说三桂让清兵入关，解决闯?，三桂只求将自成、弘遇处死及保护圆圆，满清终入主中原。
　　世显得知长平未死消息，打算南下找她，昭仁讹词不适推搪，不果，竟悄悄归顺大清。可法发现宝伦策划刺杀周后，及时化解危机，却无意中揭破周奎欲夹带私逃，周后无奈将父交往内务府处理。清兵南下，宝伦拒领兵抗?，幸可法一次又一次将清兵击退。世显与长平久别重逢，周后催促二人成亲，昭仁违心道贺。世显与可法、周后商讨国事，昭仁却暗中将布阵图交与满清探子。

第29集 
　　　　长平发现昭仁说谎，且形迹可疑，遂跟踪她，果然发现她将一竹筒交给市集贩子，二人纠缠时，可法路过，搜出昭仁通番卖国的证据，福王与宝伦趁机落井下石，却被以二人打扰商讨国事为由，赶二人离开。昭仁卖国罪证确凿，周后决定秉公处理。长平知周后在人前强装硬朗，内心难过，上前安慰。
　　昭仁见周后不理自己死活，以绝密消息引福王相见。长平与世显成亲日，周后闻昭仁悬梁上吊，赶往探望，不料被昭仁狠心枪杀，并乘乱逃走。周后临终前作最后部署，并叫众人将崇祯遗训重念一次后，终气断身亡。福王欲逼慈照交出帝位，不料众人早有准备，福王气忿离去。福王带兵入城，慈照为免引发内战，无奈提出两王并立，共掌朝政，福王遂提出削世显职权及调他往边疆，更要长平削发为尼，而慈照亦要宝伦交出兵权，福王为得王位牺牲宝伦。
　　长平与世显再度面临分离，依依不舍。慈照欲厉精图治，却处处掣肘于福王，而清军步步进逼，南明只剩下金陵可守。世显回京，痛责慈照纵情酒色，忘了周后遗训。清军向金陵进发，昭仁使计令多尔衮让自己做随行监军。世显与长平在庵内重逢，仿如隔世。福王知清兵向金陵进攻，竟闻风先遁。昭仁监军至金陵城外，要世显出城相见。

第30集 
　　　　昭仁以一万枚红夷大炮威胁世显整夜相伴，世显为免伤及金陵人民性命无奈就范。世显彻夜未回，众人恐他遭意外，催促慈照决定后着，慈照慌乱，不肯下决定。世显求昭仁让清兵和平进城，不料翌日昭仁竟将他押下，并要长平相见，世显知她不怀好意，发难，昭仁即以下令发炮屠城相胁，世显投降。
　　长平出城到清军营见昭仁，知道周后果然是昭仁杀死，痛心，昭仁指一切皆是自己被逼得走投无路才做成的，更逼长平说出哪一件事是由自己主动害人，来证明自己有理，长平无奈，只求她放过金陵百姓。昭仁处死长平与世显，二人却以平静的心面对，更甜蜜地回想往事，昭仁更感不是味儿。多尔衮突然来到军营，主持大局，命昭仁放长平与世显，指为免引起暴动，要对汉人采取怀柔政策，因知长平深得民望，劝她与世显归顺大清，及替二人在京城圆婚，表达满汉一家，粉饰太平。
　　长平与世显要求多尔衮和平进城，以及将昭仁收监，交内务府彻查她杀周后一事，昭仁哀求多尔衮，不果。慈照交出降书，结束南明。长平与世显返京，向多尔衮提出十七项要求方肯圆婚，经讨价还价后，二人上殿见清帝顺治，并获准往景山一游。长平与世显终得偿所愿，在二人栽种的连理树下，交杯喝下砒霜。